阿兔等人已升上高中了，然而原先被美少女战士们封印的黑暗女王尼希弥莉亚却被解除了封印而复活，并着手对战士们进行报复。故事就此开始……这个解除了封印的人，原来就是传说中最强的美少女战士－加拉西亚。尼希弥莉亚被送回童年时代后，豆钉兔返回30世纪，地场卫亦前往美国留学，这时偶像组合Three Lights突然出现，引起哄动，另一方面加拉西亚欲透过收集星宿种子来吞噬整个银河系，一场关乎银河系命运的终极战斗随即开始……殊不知，加拉西亚竟是一名被超级恶魔混沌操纵的银河系守护者……